真实主客体动力学
为最常用的羧基化柱[6/7]芳烃定制的高精度分子力场,克服通用力场对柔性和非对称主客体结合描述失真的问题。
王晓慧 · Zuo-Yuan, Zhang · 何晓 · 刘志荣 · Sun, Zhaoxi
Journal of Chemical Theory and Computation 2024
通过第一性原理与高级采样系统性检验,证明参数化后的模型能重现结合态与非结合态的构象系综,消除了通用力场造成的系统性偏差。
高级采样揭示柱芳烃主客体复合物普遍存在多模态结合,非单一最低能量构象,这改变了传统基于单一结合模式的解释与设计逻辑。
在正确动力学基础上给出结合自由能等热力学量估计,为柱芳烃-药物体系的分子设计提供定量标尺。
阐明了柔性大环(柱芳烃)与刚性主体(葫芦脲等)在力场描述上的本质差异,指导模拟实践。