水稻全基因组结构变异标记集

预测省时过半

以2.6万余结构变异为分子标记，在保持较高预测准确度的同时大幅缩短基因组选择计算时间，为水稻育种提供高效标记资源。

Liang, Lunping · Zhang, Chaopu · Linjun, Yu · Tingting, Sheng · Shuyue, Zheng · Shijiao, Li · Shuran, Zhou · Feng, Ting · Zhang, Fan · 黎志康 · 崔彦茹 · Wensheng, Wang · 黎珉

Crop Journal 2025

参数信息

计算时间节省

53.8–77.8 %

SV标记数量

26,000+

SNP标记数量

180,000+

被比较性状数

20

使用的基因组选择模型数

9

SV中缺失和易位比例

>90 %

技术优势

计算时间节省过半

在达到可接受预测准确度时，SV标记的基因组选择计算时间比SNP节省53.8%–77.8%，提高了计算效率。

对高遗传力性状效应更强

SV作为标记在获得可靠基因组估计育种值方面的主要优势源于它们对高遗传力性状具有更大的表型效应。

应用场景

• 水稻分子育种：提供26,000+ SV标记集，用于水稻基因/QTL定位与等位基因挖掘。
• 作物基因组选择：以SV替代SNP可节省53.8%–77.8%计算时间，加速作物GS模型训练。
• 分子标记辅助育种：SV标记对高遗传力性状效应更大，可提高分子标记辅助选择的效率。