家蚕丝素重链基因
收集264条丝素重链基因完整序列，揭示家蚕驯化与育种中的变异规律，可作为品系鉴定标记。
陆蔚 · 张彤 · 张权 · Zhang, Na · 贾凌 · Ma, Sanyuan · 夏庆友 · 张同
Insects 2023
参数信息
- 野生型平均FibH长度
- 19,698 bp
- 地方型平均FibH长度
- 16,427 bp
- 改良型平均FibH长度
- 15,795 bp
- 5'末端非重复区一致性
- 99.74 %
- 3'末端非重复区一致性
- 99.99 %
- 转录因子结合位点一致性
- 100 %
- 家族I品系数
- 62
- Opti-FibH长度
- 15,960 bp
技术优势
序列覆盖广
从高分辨率泛基因组中提取了264条完整序列，覆盖野生、地方和改良品系，为鉴定提供了丰富参考。
末端区高度保守
所有序列的5'和3'末端非重复区一致性分别达99.74%和99.99%，便于设计通用引物。
调控元件保守
内含子和上游序列中的转录因子结合位点100%一致，暗示功能保守，可用于功能研究。
品系分型清晰
以FibH基因为标记，地方和改良品系被分为四个家族，其中家族I含62个品系，可用于品系归类。
应用场景
- 家蚕品系鉴定：利用FibH序列差异，通过PCR或测序比对快速区分品系。
- 家蚕育种：揭示驯化与育种中FibH变异规律，指导分子标记辅助选育。
- 丝蛋白材料：提供FibH序列信息，为丝蛋白结构与材料性能关联分析打基础。
- 生物资源保存：以FibH基因作为遗传标记，帮助鉴定和保存家蚕种质资源。