防风抽薹开花基因

萌芽期即锁定

从防风转录组中挖掘并验证了调控抽薹开花的关键基因,可用于早期分子鉴定和育种筛选。

Min, Zhang · Wang, Wenle · Liu, Qian · Zang, Erhuan · Lijun, Wu · Guofa, Hu · 李旻辉

Chinese Herbal Medicines 2023

参数信息

高质量 clean reads 数
249889422
组装的 unigenes 数
67866
Unigene 平均长度
948.1 bp
差异表达基因数
993
上调基因数
484
下调基因数
509
显著富集的 GO 条目数
79
KEGG 富集的 unigenes 数
11154

技术优势

锁定关键调控基因

筛选出21个抽薹开花相关候选基因,其中IAA和TIR1是植物激素信号转导通路中的关键基因,可作为分子标记或干预靶点。

表达数据可靠

qRT-PCR验证7个候选基因的表达趋势与转录组测序结果一致,保证候选基因的可靠性。

资源覆盖广

获得249,889,422条高质量reads并组装67,866个unigenes,为防风功能基因组研究提供丰富资源。

应用场景