金水炭疽菌全基因组

黄连炭疽病原基因组

该基因组包含10条染色体和5条迷你染色体，为研究黄连炭疽病的致病机制与防治提供了完整遗传背景。

Wang, Qian · 张淑 · Chang, Qian · Yang, Xiao Lin · 周阳 · 罗朝喜 · Lv, Liang

Microbiology Resource Announcements 2025

参数信息

基因组大小

52.13 Mb

N50

5.05 Mb

染色体数目

10

迷你染色体数目

5

预测基因数

13129

技术优势

染色体级别组装

测序结合PacBio Revio和MGI DNBSEQ-T7 PE150，组装出10条染色体和5条迷你染色体，为研究致病基因在染色体上的分布提供完整框架。

基因预测有表达证据

13,129个基因的预测利用了RNA-Seq数据，提高了基因结构注释的可靠性，为后续功能研究打下基础。

关键遗传信息齐全

同时获得核基因组和环状线粒体基因组，为研究真菌能量代谢和遗传多样性提供参考。

应用场景

• 黄连病害防控：定位与致病相关的基因，设计针对性杀菌剂或抗病品种。
• 真菌基因组学：作为炭疽菌属比较基因组学的参考，分析染色体进化与基因家族扩张。
• 植物病原检测：开发特异性分子检测标记，快速区分金水炭疽菌与其他近缘种。