玉米B染色体基因组组装

揭示表观遗传特征

一份高精度组装与详细表观遗传图谱，为研究B染色体驱动机制及其与宿主基因组冲突提供关键资源。

Liu, Qian · 刘阳 · Congyang, Yi · Gao, Zhi · Zeyan, Zhang · Zhu, Congle · Birchler, James A. · 韩方普

Genome Biology 2025

参数信息

蛋白编码基因数量

1124

重复序列占比

88.55 %

技术优势

基因组已完整组装

用长读长测序技术，成功组装了携带两个B染色体的二倍体玉米B73基因组，获得了B染色体的完整序列，包括重复区域。

着丝粒精确定位

通过CENH3 ChIP-seq数据确定了B染色体着丝粒位置，发现其由独特的单体卫星阵列组成，与染色体臂上的不同。

全基因组表观图谱

提供了DNA甲基化、组蛋白修饰和R-loop分布的详细图谱，发现常染色质区高H3K4me3、H3K9ac和基因表达。

可助力人工染色体

准确的组装和表观遗传图谱将帮助理解驱动机制，并加速人工染色体的构建。

应用场景

• 玉米遗传改良：为玉米育种提供B染色体序列，辅助基因定位。
• 作物基因组学：可作为其他作物B染色体比较基因组学研究的参考。
• 染色质结构研究：提供着丝粒和异染色质的高分辨率表观修饰数据。
• 人工染色体构建：着丝粒序列信息可直接用于构建人工染色体载体。