CTCF锚定增强子

激活免疫基因

一种通过CTCF锚定的增强子，能够在免疫应答中重塑染色质构象，为解析猪的抗病机制提供了新的关键靶点。

曹建华 · Ren, Ruimin · Xiaolong, Li · Zhang, Xiaoqian · 孙燕 · Tian, Xiaohuan · 刘茹 · 刘向东 · Ruan, Yijun · 李国亮 · Zhao, Shuhong

Genomics, Proteomics and Bioinformatics 2024

技术优势

感染后基因激活机制明确

Poly(I:C)诱导后，CTCF锚定的增强子通过长程相互作用激活免疫基因，这一机制在猪巨噬细胞中得到验证。

提供基因编辑新靶点

鉴定的CTCF锚定增强子及相关SNP可为猪抗病育种提供可操作的基因编辑靶点。

解析SNP与基因转录的空间关系

ChIA-PET数据支持SNP与相关基因转录在三维基因组层面的空间关联，为挖掘疾病相关调控变异提供新视角。

应用场景

• 猪抗病育种：利用CTCF锚定增强子作为分子标记筛选或编辑抗病基因，加速抗病猪种培育。
• 免疫基因调控：揭示CTCF介导的染色质互作如何调控免疫基因表达，为免疫应答机制研究提供新框架。
• 基因编辑靶点：这些增强子序列或相关SNP可作为基因编辑的精确靶点，用于验证功能或改良性状。