定向边推断更准
通过边反转增广与双编码器学习源/靶向量,专为有向基因调控网络设计,提升调控边预测准确性。
Kaifu, Long · Qu, Luxuan · Wang, Weiyiqi · Wang, Zhiqiong · Mingcan, Wang · 信俊昌
Knowledge-Based Systems 2025
针对有向图的拓扑特性设计了边翻转增广,将原始图转为源视图和靶视图,让有向边两端的节点在不同视图中获得不同的上下文。
两个基于注意力的编码器分别为每个节点学习源向量和靶向量,能够捕捉有向图中更丰富的语义和不对称的节点关系。
随着模型参数不断优化,调控边的源节点和靶节点在表示空间中间接被拉近,便于解码器识别这种模式。
在DREAM5和七个单细胞RNA测序数据集、四种真实网络类型上均取得更好性能,展现出大规模基因调控网络推断的潜力。