高再生棉花基因组

精准编辑不掉靶

端粒到端粒的完整基因组组装,解析体细胞胚胎发生关键区域,为棉花遗传转化提供高再生种质资源。

Xu, Zhongping · Wang, Guanying · Zhu, Xiangqian · Ruipeng, Wang · Zhu, Longfu · Tu, Lili · 刘玉玲 · 彭仁海 · Lindsey, Keith · 王茂军 · 张献龙 · 金双侠

Nature Genetics 2025

参数信息

端粒到端粒组装
T2T
着丝粒区域
30.1 Mb
5S rDNA 阵列
8.1 Mb
45S rDNA 阵列
75.1 Mb
再生调控基因
AGL15

技术优势

基因组完整组装

获得 Jin668 端粒到端粒序列,着丝粒、rDNA 阵列等复杂区域得到解析,为功能研究和编辑设计提供准确参考。

注释再生关键区域

着丝粒与 rDNA 阵列的解析揭示再生相关基因组背景,可作为筛选高再生种质的依据。

揭示再生调控网络

比较再生与难再生基因型,找到动态转录与染色质可及性变化,并鉴定 AGL15 为再生贡献因子。

降低脱靶风险

基于完整 Jin668 基因组设计 sgRNA 可避开变异位点,降低 CRISPR 编辑脱靶概率。

应用场景