揭示木质纤维素饮食适应性
为大熊猫肠道微生物组研究提供了迄今最全面的基因参考目录和宏基因组组装基因组资源。
Yang, Shengzhi · Deng, Wenwen · Guo, Li · Jin, Lei · 黄燕 · Li, Desheng · 张安云 · Chengxi, Liu · Zhang, Hemin · 徐怀亮 · Penttinen, Petri · 赵珂 · 邹立扣
Environmental Research 2023
基于177个粪便宏基因组构建的基因目录，能系统检测抗生素耐药基因的丰度与分布，发现圈养个体中ARGs丰度更高。
重建了393个MAGs，发现Clostridium菌株富集于成年和野生个体，其基因组含有完整的木质纤维素降解和SCFA合成途径。
发现Escherichia是圈养大熊猫肠道中的优势属和主要ARGs载体，提示存在通过该菌传播耐药性的高风险。
在圈养和野生个体中均检测到多种mcr基因变体，这类质粒介导的粘菌素耐药基因具有水平转移潜力。