耐盐耐旱QTL番茄

幼苗期耐盐耐旱

该番茄种质携带两个主效QTL，可用于标记辅助选育耐盐耐旱品种。

Li, Xin · Liu, Xiyan · Pan, Feng · Hu, Junling · Zhang, Chen · Liu, Yan · Wang, Yong · Can, Zhu · 国艳梅 · 黄泽军 · 王孝宣 · 杜永臣 · 刘磊 · 李君明

BMC Genomics 2024

参数信息

耐盐QTL数

5

表型变异解释率范围

4.91-15.86 %

两年重复检出的主效QTL数

2

技术优势

两年稳定检出

两个主效QTL qST7和qDT1-3在两年重复实验中均被检测到，说明其效应可靠，不易受环境波动影响。

锁定候选基因

通过QTL区间分析，确定了候选基因SlMSRB1和SlBRL1，并分析了潜在功能变异，为功能验证和基因编辑提供明确靶点。

揭示育种选择信号

利用番茄群体重测序数据，分析了有利QTL等位基因在育种过程中的频率变化，为分子标记辅助选择提供依据。

应用场景

• 耐盐番茄育种：利用qST7等位基因进行分子标记辅助选择，加速耐盐品种培育。
• 耐旱番茄育种：利用qDT1-3等位基因进行分子标记辅助选择，提高幼苗期耐旱性。
• 标记辅助选择：提供稳定的QTL标记和候选基因，用于设计分子标记开展精准选择。