TaSPL14转录因子

调控维管发育

一个在面包小麦根部发现的转录因子,通过调控BAM1表达参与维管发育,为谷物根系改良提供了新的基因靶点。

何超 · Wang, Yating · Lu, Kang · Su, Handong · 杨芳 · 李强 · Mao, Hailiang · 陈迪俊 · 陈伟 · Kaufmann, Kerstin · Yan, Wenhao

Genome Biology 2023

参数信息

细胞类型数
22

技术优势

定位细胞类型

采用单核RNA-seq和ATAC-seq,在单个细胞水平识别出22种细胞类型,避免了组织混合造成的偏倚。

重建分化轨迹

重建细胞分化轨迹,发现小麦根表皮/皮层与内皮层起源不同,与拟南芥存在差异。

锚定关键因子

鉴定出决定细胞类型身份的核心转录因子,其中TaSPL14通过激活BAM1表达参与维管发育。

构建调控网络

整合单细胞转录组和染色质可及性数据,构建根毛分化的伪时间调控网络,发现MYB3R4、REF6、HDG1和GATAs是关键调节因子。

应用场景