癌症免疫状态预测
一个基于BERT的深度学习框架，通过预训练的蛋白质语言模型来提取TCR序列的深层上下文信息，准确预测癌症相关的免疫状态。
张旻 · Cheng, Qi · Wei, Zhenyu · Jiayu, Xu · Xu, Nan · Zhao, Chengkui · 俞磊 · 冯伟兴
Briefings in Bioinformatics 2024
通过提取TCR序列间和序列内的深层上下文信息，大幅提升AUC。
在多个公共外部数据集上验证了区分癌症患者与健康个体的能力。
在覆盖17种癌症和健康样本的数据上训练，能够分类多种癌症。