食源性李斯特菌基因组

毒力基因明确

对甘肃食品中分离的单增李斯特菌和无害李斯特菌进行全基因组测序与泛基因组分析，揭示毒力基因差异。

Jing, Zhang · Guang, Lan · Yanqin, Shen · Jing, Yan · Xiaoju, Liu · 王伟 · Xiao, Jing

Chinese Journal of Food Hygiene 2024

参数信息

单增李斯特菌携带LIPI-1菌株数

25

单增李斯特菌携带内化素基因菌株数

25

单增李斯特菌携带LIPI-3菌株数

0

单增李斯特菌ST87携带LIPI-4菌株数

2

无害李斯特菌携带LIPI-1菌株数

0

无害李斯特菌携带内化素基因菌株数

0

无害李斯特菌携带LIPI-4菌株数

7

无害李斯特菌携带LIPI-3菌株数

5

技术优势

毒力基因差异明确

25株单增李斯特菌均携带LIPI-1和内化素基因，而无害李斯特菌均不携带，从基因组层面解释了致病性差异。

分型分辨力高

核心基因组多位点序列分型能有效区分不同谱系和克隆群，在本研究中将32株菌分为3个谱系群和15个克隆群亚群。

核心基因组稳定

单增李斯特菌的核心基因数在菌株数达15时稳定在2272个，且与无害李斯特菌共享1487个核心基因，为泛基因组研究提供基线。

应用场景

• 食源性病原体监测：利用核心基因组分型精准追踪食品中李斯特菌污染来源和传播路径。
• 食品安全风险评估：根据毒力基因携带情况判断食品中李斯特菌株的致病风险等级。
• 病原体检测：筛选特异性毒力基因靶点，用于区分单增李斯特菌和无害李斯特菌的检测方法。