银杏miRNA-PHAS调控网络

解析银杏中miRNA与phasiRNA的多层次调控网络，揭示其在生殖发育和黄酮生物合成中的协同作用机制。

Ang, Xu · Anqi, Zhao · Shi, Lisha · 王琪 · 杨晓明 · 薛良交 · 曹福亮 · Fu, Fangfang

Plants 2025

参数信息

miRNA数量

746

phasiRNA前体位点数量

654

受miRNA触发的PHAS位点比例

80 %

触发PHAS的miRNA数量

515

技术优势

首个银杏多组学sRNA数据集

基于sRNA、转录组和降解组三个文库整合分析，提供了银杏中miRNA和phasiRNA位点的全面注释。

揭示生殖发育的调控模块

miR159/miR319-PHAS模块通过靶向GAMYB基因并触发phasiRNA产生来调控生殖发育。

连接黄酮合成调控

miR390-PHAS模块通过靶向查尔酮合成酶和花青素合成酶参与黄酮生物合成。

提出两种调控模式

发现生长相关因子仅由miRNA调控，而某些抗病基因同时受miRNA和phasiRNA调控，表明不同生物过程具有多样调控机制。

应用场景

• 银杏遗传改良：利用鉴定到的miRNA-PHAS模块精准调控生殖发育，加速银杏良种选育。
• 植物代谢工程：通过miR390-PHAS模块改造黄酮合成通路，提高银杏叶中黄酮类化合物产量。
• 植物合成生物学：在合成生物学回路中利用miRNA-PHAS模块实现多基因协同调控，提升代谢通路效率。