香薷科植物质体

这是香薷科物种的完整质体基因组，可作为系统发育和分类学研究的分子标记来源。

Tu, Xiongde · Zhao, Zhuang · Zhou, Chengyuan · Zeng, Mengyao · Gao, Xuyong · 李明河 · 刘仲健 · Chen, Shipin

International Journal of Molecular Sciences 2023

参数信息

质体基因组大小

148288 bp

质体基因组大小

152602 bp

基因总数

132

独特基因数

113

蛋白编码基因数

85

tRNA 基因数

37

假基因数

2

技术优势

标记可用

鉴定了具有高变异性的 CDS 和基因间区序列，可作为香薷科分类学研究的潜在分子标记。

系统发育树更稳健

利用 CDS 或 CDS+IGS 数据集都能构建得到支持率更高的系统发育树。

序列差异小

比较分析显示这些物种的质体在基因水平上仅存在微小变异。

应用场景

• 药用植物鉴定：利用高变标记区分亲缘关系近的药用物种，辅助药材真伪鉴定。
• 作物遗传育种：提供种质资源鉴定的分子标记，辅助香薷科作物的遗传改良。
• 芳香植物开发利用：通过系统发育关系指导芳香物种的筛选和资源开发利用。