自由生活慢生根瘤菌

污染沉积物新种

该菌株为慢生根瘤菌属新种，拥有非共生固氮和自养代谢相关基因，为研究该属基因组异质性和环境适应机制提供了新遗传材料。

Chun-Zhi, Jin · 李胎花 · Feng-Jie, Jin · Lee, Jeong Hyung · 金龙

Frontiers in Microbiology 2023

参数信息

基因组大小

7.3 M

染色体数目

1

技术优势

无需宿主即可固氮

基因组中含有非共生固氮基因，使该菌株在自由生活状态下也能固定氮气，不依赖植物共生。

具备自养代谢潜力

基因组编码核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶（RubisCO），可在环境变化时灵活进行自养生长。

可参与硫氧化和膦酸代谢

基因组中鉴定到硫氧化、磺酸盐转运、膦酸降解与合成相关基因，提示其在沉积物元素循环中发挥作用。

应用场景

• 微生物氮循环：用于解析自由生活细菌在氮循环中的贡献，特别是在非共生固氮和反硝化中的作用。
• 污染沉积物修复：该菌株来自污染沉积物，具备硫氧化和膦酸降解基因，或可用于原位生物修复。
• 非共生固氮：缺少结瘤基因但携带固氮基因，为研究非共生固氮机制提供模式菌株。
• 微生物基因组资源：作为新种全基因组序列，可用于比较基因组学和功能基因挖掘。