单细胞RNA异构体分析

高通量高精度

移除伪cDNA并串联多个cDNA进行PacBio CCS测序，实现高通量高准确度单细胞RNA异构体测序。

Zhuo-Xing, Shi · Chen, Zhichao · Jia-Yong, Zhong · Kun-Hua, Hu · Yingfeng, Zheng · Chen, Ying · Xie, Shang Qian · 伯晓晨 · Luo, Feng · 唐冲 · 肖传乐 · 刘奕志

Nature Communications 2023

参数信息

长读长产量

>10 million reads

解复用准确度

>99.99 %

解复用特异性

>99.99 %

分析细胞数

3375 cells

技术优势

解复用准确

scISA-Tools以超过99.99%的准确度和特异性将串联读长拆分为单细胞cDNA读长。

技术易得

该方法在常规PacBio平台上即可实施，无需特殊设备。

应用场景

• 细胞类型特异性异构体发现：揭示角膜缘细胞中细胞类型特异的异构体表达模式。
• 长读长单细胞转录组学：加速长读长单细胞转录组学领域的发展。
• 异构体表达分析：提供高精度长读长数据以准确分析异构体表达。