耐热珍珠粟种质

RWP-RK与ER系统协同

基于泛基因组发现的RWP-RK转录因子与内质网相关基因协同作用，赋予珍珠粟优异的耐热性，为培育耐热作物提供了关键的基因资源和种质基础。

Yan, Haidong · Sun, Min · Zhang, Zhongren · Yarong, Jin · Zhang, Ailing · Lin, Chuang · Wu, Bingchao · Min, He · Xu, Bin · Jing, Wang · Peng, Qin · Mendieta, John Pablo · Nie, Gang · Wang, Jianping · Jones, Chris Stephen · 冯光燕 · Srivastava, Rakesh Kumar · 张新全 · Bombarely, Aureliano · 罗丹 · Jin, Long · 彭远英 · 王小山 · Ji, Yang · 田仕林 · 黄琳凯 · 黄琳凯

Nature Genetics 2023

参数信息

结构变异数量
424,085
染色体水平基因组组装数
10

技术优势

找到可操作的耐热基因

过表达一个RWP-RK基因即可增强植株耐热性，并快速反式激活内质网相关基因，为耐热改良提供了明确的基因靶点。

锁定耐热性相关结构变异

泛基因组捕获了424,085个结构变异，并发现部分SV影响耐热相关基因表达，且ER相关基因周围的SV在驯化过程中塑造了耐热适应性，可直接用于分子标记开发。

覆盖全球气候适应性多样性

组装的10个染色体基因组来自适应不同气候的全球材料，结合一个已有组装，构建的泛基因组能更好地代表珍珠粟的遗传变异，为耐热育种提供更全面的资源。

揭示耐热调控新模块

比较基因组和转录组分析揭示了RWP-RK转录因子家族的扩张以及内质网相关基因参与耐热性，RWP-RK可快速激活ER系统，构成协同调控网络。

应用场景