表皮兰完整质体

五种表皮兰物种的完整质体基因组首次完成测序组装,揭示了高变热点和系统发育关系,为兰科植物分类与进化研究提供关键基础。

Zhao, Zhuang · Yu-Wei, Wu · Li, Wei · Zhou, Zhuang · 刘仲健 · Li-Ming, Lin

International Journal of Molecular Sciences 2023

参数信息

质体基因组长度
147,902–150,986 bp
GC含量
37.16–37.33 %
蛋白编码基因数
78–82
长重复数
25–38
SSR数
130–149

技术优势

首次提供完整序列

首次完成5种表皮兰的质体基因组测序组装,填补该属数据空白。

鉴定出高变热点

鉴定出4个高变热点,可用于后续系统发育和物种鉴定研究。

系统发育关系明确

基于43个质体基因组构建的系统发育树支持表皮兰属为单系群,并与卡特兰属为姐妹群。

应用场景