洛神花SSR标记

稳定多态可鉴定

基于转录组开发的SSR标记能够稳定地区分洛神花品种并构建指纹图谱,为分子鉴定和辅助育种提供可靠工具。

陶爱芬 · Yunqing, Li · Jihan, Chen · 李景 · 徐建堂 · 林荔辉 · 张立武 · 方平平

Plants 2024

参数信息

多态性引物数
32
SSR位点总数
12994
SSR位点频率
11.36 %
SSR分布密度
6.87 Kb
多态性比例
32.0 %
高/中多态性引物数
27
高多态性引物数
7
构建指纹图谱的品种数
38

技术优势

多态够用

32对引物中,有27对具有高或中等多态性,足以区分38个品种的遗传关系。

无需测序

使用常规PCR即可获得清晰稳定的多态性条带,不需要昂贵的高通量测序。

同域可归簇

遗传关系分析表明,来自相同区域的品种倾向于聚在一起,便于追踪种质来源。

五对即指纹

仅用5对SSR引物即可构建38个品种的DNA指纹图谱,实现高效分子鉴定。

应用场景