CRISPR-Cas12a 活性预测模型

整合分子相互作用

整合DNA序列与分子相互作用特征，显著提升crRNA引导的反式切割活性预测准确性，加速核酸诊断应用。

Zhihao, Yao · He, Kaiyu · 徐岩 · 吴群 · Wang, Liu · 聂尧

Advanced Science 2025

参数信息

预测准确性（Pearson's r）

0.9328

crRNA-DNA库特征序列数

23456

技术优势

预测更准

同时考虑序列特征和分子相互作用特征，突破常规工具仅依赖序列的限制，显著提高预测精度。

特征可解释

通过特征重要性分析识别出影响Cas12a反式切割活性的关键序列特征，为设计提供指导。

有大数据支撑

构建了包含23,456条特征序列的crRNA-DNA库，并在参考靶标上验证了模型的高预测准确性。

应用场景

• 核酸诊断：快速设计高活性crRNA，加速病原体检测。
• CRISPR诊断：替代盲目筛选，精准预测反式切割活性。
• 生物信息学工具：提供整合分子相互作用的预测模型，可直接嵌入流程。