拟南芥泛基因组

一个图结构泛基因组,涵盖32个生态型,揭示结构变异与局域适应的关联。

康明辉 · Wu, Haolin · 刘唤唤 · Liu, Wenyu · Zhu, Mingjia · Yu, Han · Liu, Wei · Chen, Chunlin · Yang, Zhen · Lou, Shangling · Zan, Yanjun · 刘建全

Nature Communications 2023

参数信息

与结构变异重叠的基因数
18883
HPCA1启动子插入片段长度
332 bp

技术优势

可鉴定适应性结构变异

通过图结构泛基因组,全面鉴定出61,332个结构变异,其中与18,883个基因重叠,为功能研究提供候选。

定位高山适应关键变异

在西藏生态型HPCA1启动子区发现332 bp插入,显著增强基因表达,是高山适应的直接证据。