水生RNA病毒YS-LWW

海岸淡水广泛分布

该病毒株在沿海和淡水环境中被广泛检出，代表Locarnavirus属的一个新种。

Wu, Shuang · Yu, Yongxin · 傅松哲 · 王永杰

Archives of Virology 2023

参数信息

基因组长度

8839 nt

开放阅读框数量

2

新种相关分离株数量

45

技术优势

检测覆盖广

PCR和公共数据集挖掘表明该病毒在沿海和淡水环境中广泛存在，可用于环境筛查。

分类地位明确

RdRP和全基因组系统发育分析支持其与45株分离株构成Locarnavirus属新种，便于后续研究引用。

基因组信息完整

获得全长8839 nt的完整基因组序列，包含两个ORF，为功能研究提供基础。

应用场景

• 水产病原检测：以其序列为参考设计引物，筛查水产环境中的该病毒。
• 水生生态监测：作为指示病毒，追踪其在沿海和淡水生态系统中的分布。
• 噬菌体资源开发：提供RNA病毒基因组模板，辅助开发相关噬菌体资源。