BrAGPS1启动子关联因子

这些候选蛋白为解析根肿病感染期间淀粉代谢的转录调控提供了可验证的切入点。

Wang, Xiaohui · Li, Ying · 姜晶 · 梁月 · 庞文星

Frontiers in Plant Science 2026

参数信息

非冗余文库命中数

76

具有潜在相关功能的命中数

15

差异表达基因数

28

优先候选因子数

5

技术优势

锁定关键候选

通过功能注释和感染响应表达，从76个文库命中中筛选出5个优先候选，避免对大量未知蛋白进行盲目验证。

提供现成文库

已构建感染后1、3、5周的根系cDNA文库，可用于后续一对一回复验证、EMSA、启动子反式激活等实验，直接节约文库构建时间。

整合转录组数据

将Y1H结果与1、2、3、5周RNA-seq时间进程数据整合，识别出28个在至少一个时间点差异表达的基因，为候选因子提供表达动态证据。

应用场景

• 白菜抗根肿病育种：利用候选因子调控淀粉积累，培育抗根肿病品种。
• 植物碳代谢基因工程：通过调控AGPase表达重编程碳代谢，提高抗病性或产量。
• 转录调控元件挖掘：提供启动子关联蛋白集合，用于鉴定调控元件的结合因子。