甜瓜硬度主效位点ff2.1

28.3 kb锁定三候选基因

甜瓜果实硬度的主效QTL位点ff2.1被精细定位至28.3 kb区间,包含三个功能候选基因,为甜瓜硬度的分子标记辅助选择育种提供了直接可用的基因资源。

Ke-xin, CHEN · Dai, Dongyang · 王玲 · Yang, Limin · Dandan, Li · 王超 · Ji, Peng · Sheng, Yunyan

Journal of Integrative Agriculture 2023

参数信息

精细定位区间
28.3 kb
初始候选区间
0.17 Mb
SLAF标记数
112844
构建图谱的SNP数
5919
遗传图谱总长度
1356.49 cM
QTL数目
10
精细定位群体大小
429

技术优势

定位到主效位点

在两年重复试验中均检测到一致的主效QTL(ff2.1),说明其效应稳定,可直接用于标记辅助选择。

区间缩到28.3 kb

利用429个F2个体将区间从0.17 Mb缩小到28.3 kb,只含三个候选基因,大大减少了后续功能验证的工作量。

候选基因明确

精细定位区域内只有三个功能基因,为后续克隆和机理解析提供了清晰的目标。

应用场景