揭示环路诱导陷阱态
发现环路导致一个陷阱态，使碱基对形成的限速步骤变为陷阱态的破坏，与未打结RNA机制根本不同。
Zhang, Shuhao · 王震 · Qiao, Jie · 于霆 · 张文炳
Journal of Chemical Physics 2024
发现环路诱导一个陷阱态，使碱基对形成的限速步骤变为陷阱态的破坏，而非从开放态到闭合态的转变，这与之前对非伪结RNA的研究不同。
模拟得到的伪结中堆叠的热力学参数与最近邻参数接近，支持该模型在伪结中的适用性。
本模拟与最近邻模型在打开碱基对时的熵差源于溶液中不同长度环路的熵不同，为理解环路长度效应提供了依据。