双栖普雷沃氏菌全基因组

首个完整基因组

首个完整的双栖普雷沃氏菌基因组，为临床感染管理提供关键基因组资源。

Peng, Yao · Cai, Xunchao · Deng, Li · Yue, Xiao · 徐龙 · 侯祺

Journal of Global Antimicrobial Resistance 2023

参数信息

基因组完整度

99.66 %

基因组大小

2.43 Mb

G+C含量

39.5 %

chr1长度

1272652 bp

chr2长度

1155021 bp

chr1编码序列数

1132

chr2编码序列数

1055

人类病原体概率

0.614

技术优势

补齐了物种空白

首次提供该物种的完整基因组序列，为后续比较基因组学和功能研究提供基础。

注释质量显著提升

与草图基因组相比，假想蛋白注释比例显著降低。

锁定β-内酰胺耐药基因

注释到β-内酰胺类耐药基因cfxA3，提示该菌对相关抗生素的耐药潜力。

应用场景

• 细菌耐药性监测：提供耐药基因cfxA3参考序列，用于监测β-内酰胺类耐药性的传播。
• 厌氧菌感染治疗：完整基因组帮助理解其致病机制，指导厌氧菌感染的治疗策略。
• 病原体基因组学：首次提供该病原体完整参考基因组，促进比较基因组学分析。