梅树SV分子标记

早筛高柠檬酸种质

基于376 bp结构变异的分子标记，可在苗期筛选柠檬酸含量显著更高的梅树种质，加速育种进程。

黄小 · Zhou, Pengyu · Tan, Wei · 高峰 · Ni, Zhaojun · 侍婷 · Bai, Yang · Ma, Chengdong · Yufan, Ma · 张启翔 · Tao, Ryutaro · 万建民 · 高志红

Plant Biotechnology Journal 2025

参数信息

核心基因家族比例

64.47 %

非必需基因家族比例

35.53 %

泛基因组总长度

412.41 Mb

非冗余结构变异总数

51461

插入变异数量

15217

缺失变异数量

21683

易位变异数量

13509

倒位变异数量

1025

技术优势

苗期就能筛

开发的SV分子标记可在苗期通过PCR检测376 bp插入，无需等待结果期，即可筛选高柠檬酸种质。

柠檬酸含量显著更高

携带该SV的梅树果实柠檬酸含量与其他核果类水果相比存在极显著差异，标记直接关联目标性状。

标记有功能机制

PmAGL30能结合该SV插入，增强PmPH4基因表达，促进梅果柠檬酸积累，标记与因果变异直接相关。

应用场景

• 果树分子育种：用SV标记在苗期筛选高柠檬酸个体，加速育种进程。
• 种质资源筛选：通过PCR检测376 bp插入，快速评估种质资源柠檬酸潜力。
• 核果类遗传改良：为核果类果树提供与柠檬酸积累因果关联的分子标记。