地下水中可溯源
从地上来源传播到地下水，主要由病原菌携带，具有潜在健康风险。
Liusheng, Lei · Nan, Chen · 陈则友 · Yirong, Zhao · Lin, Huai · Xi, Li · Wenjin, Hu · Hanhui, Zhang · 史晶亮 · 罗义
Water Research 2024
基于宏基因组的源解析表明，地下水中56–95%的ARGs可归因于猪粪、废水和土壤等地表来源，改变了过去对地下水抗性基因来源不明的状况，使监测和防控可以聚焦于上方污染源头。
通过宏基因组组装发现，45个ARGs可从地上进入地下水，且主要是借助质粒介导的水平基因转移而实现，其中多数基因赋予对氨基糖苷类、磺胺类和四环素类的抗性，说明控制质粒传播可切断抗性基因向地下水扩散的路径。
抗性菌分离株中检出的sul1、tetA和TEM-1等ARGs的全长核苷酸序列在地上和地下水之间进化关系很近，部分假单胞菌分离株的全基因组平均核苷酸一致性（ANI）大于99%，从序列层面直接确认了地上与地下菌株的同源性。