甲螨28S D8条形码

种级鉴定无重叠

与常用18S和28S D3相比，该基因片段在种内与种间遗传距离之间形成显著条形码间隙，可准确区分低分类阶元甲螨。

Huilin, Chen · Yonghang, Zhu · Haiye, Fan · Wei, Zhao · Liu, Luyao · Yuxiang, Cao · Ye, Changjiang · 孙恩涛

Zhongguo ji sheng chong xue yu ji sheng chong bing za zhi = Chinese journal of parasitology & parasitic diseases 2023

参数信息

种内遗传距离
0.005
种间遗传距离
0.109
种间/种内距离比值
21.8

技术优势

种间/种内差距大

28S rDNA D8基因种间遗传距离均值0.109，种内仅0.005，比值超过20倍，远高于常用18S和28S D3基因，鉴定分辨率更高。

有显著条形码间隙

28S rDNA D8基因序列的种内与种间遗传距离之间无重叠，ABGD分析确认存在显著条形码间隙，而18S和28S D3均存在重叠区域，因此D8可作为可靠的物种界定标准。

鉴定低阶元更准

论文结论明确指出28S rDNA D8基因适合低分类阶元的物种鉴定，而18S和28S D3适合高分类阶元，因此可用于区分形态相似种。

应用场景