预测变异株感染性
结合蛋白质三维结构与结合亲和力的多任务学习框架,可预测病毒变异株与宿主受体及中和抗体的结合变化。
王光宇 · 凯王 · Gao, Yuanxu · 甘霖 · Baptista-Hon, Daniel T. · Xiaohong, Yang · Linling, Cheng · Fok, Manson · Lau, Johnson Yiu Nam · 杨胜勇 · 张 平 · Zhang Kang
Nature Medicine 2023
在残基和原子水平上表示蛋白质,同时考虑三维结构和结合亲和力,实现了多任务学习,能整合异构生物数据。
在基准数据集和实验验证中,有效且可扩展地预测了刺突蛋白变异体与ACE2受体及中和抗体的结合亲和力变化。
可应用于预测宿主对变异株的易感性和未来变异进化趋势,作为新出现问题的早期预警系统。