端粒到端粒无缺口,解析异源四倍体亚基因组演化与关键性状形成的遗传基础。
Shen, Fei · 徐世晓 · Bi, Changwei · Lysak, Martin A.
Nature Communications 2023
端粒到端粒(T2T)组装消除了以往基因组中的缺口,使着丝粒、端粒等复杂区域的序列和结构得以完整解析,为全基因组关联分析和基因定位提供完整参考。
A和B亚基因组在(表观)基因组架构与3D染色质结构上差异显著,结合长末端重复反转录转座子动态和DNA甲基化分析,揭示了驱动亚基因组分化的关键因素。
通过分析硫代葡萄糖苷(GSLs)和辣根过氧化物酶生物合成相关基因,发现多倍体化和亚基因组分化对关键性状形成有重要作用;FMOGS-OX、IGMT和GH1基因家族的持续复制与分化扩展了GSL谱。