共轭图噬菌体组装框架

宏基因组组装完整性高

将同源信号与深度学习结合,在宏基因组中直接拼出接近完整的噬菌体基因组,远超现有检测法因片段化导致的低完整度。

王若晗 · Pan, Guangze · Wang, Shuai · Wang, Jianping · Li, Shuai Cheng

Nature Biotechnology 2026

参数信息

F1 值范围
0.92-1.00
F1 提升值
0.21-0.48
高质量噬菌体基因组数量
5306
中位基因组完整度提升百分比
55.98 %

技术优势

完整度大幅领先

在 914 个样本中,PALACE 组装出的噬菌体基因组中位完整度比第二名基准方法高 55.98%,恢复更完整的噬菌体功能单元。

模拟数据近乎完美

PALACE 在多种模拟条件下 F1 均达到 0.92–1.00,比第二名方法高出 0.21–0.48,组装准确性和完整性都高。

揭示噬菌体适应机制

结直肠癌患者来源的噬菌体显著富集代谢因子,提示它们适应了肠道营养环境,为噬菌体-宿主互作提供线索。

应用场景