宏基因组组装完整性高
将同源信号与深度学习结合,在宏基因组中直接拼出接近完整的噬菌体基因组,远超现有检测法因片段化导致的低完整度。
王若晗 · Pan, Guangze · Wang, Shuai · Wang, Jianping · Li, Shuai Cheng
Nature Biotechnology 2026
在 914 个样本中,PALACE 组装出的噬菌体基因组中位完整度比第二名基准方法高 55.98%,恢复更完整的噬菌体功能单元。
PALACE 在多种模拟条件下 F1 均达到 0.92–1.00,比第二名方法高出 0.21–0.48,组装准确性和完整性都高。
结直肠癌患者来源的噬菌体显著富集代谢因子,提示它们适应了肠道营养环境,为噬菌体-宿主互作提供线索。