外生根瘤菌新菌株

根瘤菌科新属新种

基于基因组系统发育分析,结合表型与化学分类特征,确认了一个根瘤菌科的新属新种,其模式菌株为BDR2-2T。

Ma, Tengfei · Xue, Han · 朴春根 · Jiang, Ning · 李勇

Frontiers in Microbiology 2023

参数信息

核心基因数
92
直系同源蛋白数
170
模式菌株
155
cpAAI属划分阈值
86 %
新属数
8
重组物种数
22

技术优势

厘清分类冲突

通过92个核心基因和170个直系同源蛋白的系统发育分析,明确了8个新属和22个物种的重新组合,解决了并系和多系问题。

提供新的分属阈值

以约86%的cpAAI值作为属的划分界限,为后续根瘤菌科分类提供了可操作的基因组标准。

确立新属新种

结合表型和化学分类特征,确认了菌株BDR2-2T代表一个新属新种,命名为Ectorhizobium quercum。

应用场景