全基因组SSR分子标记

300对引物即用

基于高质量基因组开发的整套微卫星标记,可将紫罗兰品种准确分为切花和盆栽两个类群,且已证实可跨物种用于十字花科,为遗传分析和育种提供通用工具。

Tan, Chen · Zhang, Haimei · Chen, Haidong · 葛贤宏 · 朱博 · Chen, Daozong

Plants 2023

参数信息

SSR位点数
45,612
二核苷酸重复基序占比
77.35 %
设计引物对数
43,540
引物扩增成功率
300
多态性SSR标记数
22
遗传距离
0.68

技术优势

有现成引物池

从全基因组数据设计了43,540对引物,其中300对随机验证均成功扩增,直接用于PCR,不需要自己设计和验证。

能区分品种

22个多态性SSR标记分析40个品种,聚类结果与花型(切花或盆栽)高度一致,遗传距离0.68,可直接用于品种鉴定。

可跨种使用

这些SSR标记已在十字花科内验证有效且可转移,从而可以用于其他十字花科植物。

应用场景