提取前置质控

判别样本阈值

统一土壤DNA提取的最小样本量规范，确保微生物多样性与群落结构分析的可靠性与可比性。

Li, Ting · Zhang, Song · 胡金明 · Haiyan, Hou · Li, Kexin · Qiuping, Fan · 王芳 · 李霖锋 · Xiaoyong, Cui · Liu, Dong · 车荣晓

Soil Biology and Biochemistry 2023

参数信息

最小推荐样本量

0.25 g

低微生物密度土壤的最小样本量

0.50 g

微生物丰度不受影响的样本量范围

0.01-1.00 g

群落组成受影响的样本量阈值

0.50 g

微小生境差异显现的样本量

0.025 g

技术优势

明确最小取样阈值

多数生态系统中，至少0.25 g土壤才能可靠反映整体微生物多样性，统一标准可提高研究的可比性。

丰度测定不受样本量干扰

通过real-time PCR测定微生物丰度时，0.01–1.00 g的样本量均未造成显著差异，因此丰度分析可以灵活选择较小样本量。

避免低估共现网络密度

0.01–0.025 g的样本会低估微生物共现频率，而0.25–1.00 g的样本能揭示更完整的共现模式。

应用场景

• 土壤微生物组：为土壤微生物组研究设定最小样本量标准，确保多样性和共现结果的可靠性。
• 生态系统监测：在跨生态系统监测中统一取样量，减少因样本量差异造成的数据偏差。
• 农业土壤健康：为农业土壤健康评估提供取样量依据，避免低估微生物多样性而误判土壤状态。
• 微生物资源调查：在微生物资源调查中优化取样策略，确保低丰度类群不被漏检。