CTDE可控延伸法

高效低成本合成gRNA文库

一种基于可逆终止子的可控模板依赖延伸方法,能够以组织特异性方式合成超大容量gRNA文库,用于哺乳动物基因组功能元件的饱和筛选。

Pan, Chen · 李冉 · Shui, Liyan · Xiao, Zhengyun · Wang, Yali · Zhu, Jing · Wu, Chao · 张龙 · Jia, Junling · 郑敏

Nucleic Acids Research 2023

技术优势

覆盖度能饱和

通过可控模板依赖延伸法可以合成超大容量gRNA文库,使对特定基因组区域的筛选达到饱和覆盖,无需因文库规模不足而遗漏关键元件。

成本降下来

CTDE方法具有高效低成本的特点,且有望实现自动化,使得大规模gRNA文库的构建不再昂贵,普通实验室也能开展饱和筛选。

组织特异性合成

利用染色质免疫沉淀获得的DNA为模板,能够以组织特异性方式合成gRNA文库,使筛选结果更贴近特定细胞类型的调控图谱。

应用场景