低磷候选基因

耐低磷分子靶点

在玉米中鉴定到由QTL与GWAS共同支持的低磷胁迫响应候选基因，其中ZmPDR1在低磷下被显著诱导，为耐低磷育种提供可直接利用的分子靶点。

罗博文 · 马鹏 · Zhang, Xiao · Li, Jing · Zheng, Han · Shuhao, Zhang · 于婷 · Guidi, Zhang · Zhang, Hongkai · 张海英 · Li, Binyang · 国家 · Lan, Yuzhou · Liu, Dan · Wu, Ling · Gao, Duojiang · Gao, Shiqiang · Shunzong, Su · 高世斌

Theoretical and Applied Genetics 2024

参数信息

Pi依赖QTL数
74
HotspotQTL数
9
一致候选基因数
277
HotspotQTL内候选基因数
124
低磷特异QTL数
29
基于指数值的额外QTL数
45
非冗余Pi依赖QTL基因数
19,613
具非同义突变的基因数
6,999

技术优势

锁定低磷QTL

在排除两种磷水平下共同区间后，鉴定到74个Pi依赖QTL，其中39个聚为9个HotspotQTL，缩小了候选区域。

多组学交叉验证

联合作图群体的亲本重测序、GWAS和转录组分析，鉴定到277个一致候选基因，其中124个位于HotspotQTL区间内。

找到关键响应基因

玉米根系中的ZmPDR1在低磷胁迫下被急剧上调，提示其通过独脚金内酯途径参与低磷响应。

应用场景