无间隙猕猴桃基因组
单倍型解析
端粒到端粒的猕猴桃基因组装配，揭示了维生素C和蔗糖代谢的调控机制，为基因组育种提供了宝贵资源。
Han, Xue · Zhang, Yilin · 张琼 · Ni, Ma · Liu, Xiaoying · Wenjing, Tao · Zhiying, Lou · 钟彩虹 · 邓兴旺 · 李大伟 · 何航
Molecular Plant 2023
参数信息
- 基因组总长度（DH）
- 608327852 bp
- 基因组总长度（KY）
- 640561626 bp
- 蛋白序列变异基因位点（DH单倍型间）
- 26494
- 蛋白序列变异基因位点（KY单倍型间）
- 27773
技术优势
单倍型解析
每个基因组被分相为两套完整单倍型，使研究者能区分等位基因变异和等位基因特异性表达。
找到甜度基因
AcSWEET9b等位基因显性被证实与果实高蔗糖含量正相关，其启动子在红肉猕猴桃中受到选择，解释了红肉猕猴桃更甜的原因。
应用场景
- 猕猴桃育种：直接利用高质量基因组进行基因定位和标记开发，加速猕猴桃优良品种选育。
- 水果品质改良：利用AcSWEET9b等位基因标记筛选高糖、高维生素C的果实材料。
- 基因组选择育种：图谱完整且单倍型分明，可作为参考构建高密度变异图谱，支撑全基因组选择模型。
- 代谢调控研究：提供同步的代谢组和转录组数据，揭示维生素C和蔗糖积累的动态调控规律。