PAM非依赖碱基编辑系统

一种不依赖PAM的碱基编辑系统，可高效失活细菌中任意目标基因，效率接近100%。

李鑫 · 魏莹 · Shu-Yan, Wang · 王淑 · 夏鹏飞

Journal of Biological Chemistry 2024

参数信息

基因失活效率

100 %

脱靶事件减少幅度

60 %

技术优势

不挑PAM

使用dSpRY变体，对PAM无要求，可靶向基因组中任意位点。

效率接近100%

靶向起始密码子使基因失活，整体效率接近100%。

脱靶减少60%

通过优化调控系统限制表达水平，脱靶事件减少超过60%，且不牺牲编辑效率。

多菌株通用

在益生菌大肠杆菌Nissle 1917和蓝细菌Synechococcus elongatus中均有效。

应用场景

• 细菌基因编辑：无需考虑PAM限制，可直接失活任意基因。
• 代谢工程：用于构建氨基酸营养缺陷型菌株，精确调控代谢路径。
• 益生菌工程：在益生菌Nissle 1917中实现基因失活，用于功能改造。
• 蓝细菌工程：在蓝细菌中有效，可用于光合微生物的基因编辑。