DNA损伤修复基因启动子变异

致病变异可检

通过高通量功能筛选从DNA损伤修复基因启动子区鉴定出750个影响转录活性的罕见变异，其中下调型变异显著富集于肺癌患者，为肺癌风险预测提供功能性生物标志物。

Mingxing, An · Chen, Congcong · Jun, Xiang · 杨力 · 顾亚云 · Qin, Na · 何元林 · 朱猛 · 蒋玥 · 戴俊程 · Jin, Guangfu · Hongxia, Ma · 王诚 · 胡志斌 · 沈洪兵

EBioMedicine 2024

参数信息

罕见功能性调控变异数量

750

下调型变异比值比

1.30

上调型变异比值比

1.06

功能性变异总比值比

1.17

仅注释变异比值比

1.04

技术优势

功能筛选更准

基于功能的筛选所识别的变异在病例中显著富集（OR=1.17, p=0.026），而仅凭生物信息学注释优先的变异与对照无差异（OR=1.04, p=0.549），说明功能验证能有效区分致病调控变异。

锁定7个易感基因

携带启动子区下调型功能变异的七个基因（BRCA2、GTF2H1、DDB2、BLM、ALKBH2、APEX1、RAD51B）与肺癌易感性相关，为风险预测和机制研究提供了明确靶点。

应用场景

• 肺癌风险基因检测：检测这些功能性启动子变异，用于评估肺癌风险或辅助早期筛查。
• 癌症易感基因筛查：将七个易感基因的启动子变异纳入筛查 panel，提高风险预测灵敏度。
• 伴随诊断标志物：作为功能生物标志物，辅助肺癌易感人群的分层和预防策略制定。