蛋白-配体互作建模通用网络
准确建模蛋白-配体非共价相互作用,通过负采样策略校正互作分布,在对接和亲和力预测任务上达到SOTA。
Houtim, Lai · Wang, Longyue · Ruiyuan, Qian · Junhong, Huang · Peng, Zhou · Ye, Geyan · Wu, Fandi · Fang, Wu · Xiangxiang, Zeng · Liu, Wei
Nature Communications 2024
利用 interaction-aware mixture density network 捕获蛋白-配体非共价相互作用,而不是依赖隐式特征。
通过负采样策略校正相互作用分布,使亲和力预测更符合真实结合模式。
在公开数据集上取得了当前最优的对接性能,证明了方法的有效性。