鸡内源性ALVE插入位点

系统鉴定中国地方鸡种特有的ALVE插入位点，为标记辅助育种提供新的分子靶点。

Wang, Ziyi · Yuan, Yiming · Zheng, Gang · Sun, Meng · Wu, Jinfeng · 李俊英 · 孙从佼 · 王永强 · 杨宁 · Liang, Lina

Journal of Animal Science 2023

参数信息

ALVE插入位点总数

37

新插入位点数

23

仅在一个中国地方鸡种中发现的新ALVE数量

16

代表性插入序列长度

7525 bp

与ALVE1同源性

99 %

技术优势

揭示地方鸡特有插入位点

16个新ALVE仅在一个中国地方鸡种中发现，为品种特异性标记提供直接靶点。

插入位点全部经实验验证

通过位点特异性PCR在扩大群体中验证，11个品种的所有预测整合位点均得到确认。

应用场景

• 鸡标记辅助育种：育种者可直接用提供的位点信息开发品种特异性标记，进行标记辅助选择。
• 禽类遗传多样性：ALVE插入多态性反映品种间遗传差异，可用于评估禽类遗传多样性。
• 地方鸡种保护：品种特有插入位点可作为地方品种的分子指纹，辅助品种鉴定与保护。
• 畜禽基因组：提供鸡基因组中内源性逆转录病毒插入的精确坐标，丰富畜禽基因组注释。