miR-147缺失小鼠肺ceRNA网络

基于miR-147缺失小鼠肺组织的RNA测序，构建了lncRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA网络，揭示Kcnh6为关键枢纽基因，并表明该网络调控肿瘤相关信号通路。

Xue-Wen, Zhang · Hu, Yong Jian · Wang, Fei · 徐萍

Frontiers in Pharmacology 2024

参数信息

显著上调 lncRNA 数

91

显著上调 miRNA 数

43

显著上调 mRNA 数

71

显著下调 lncRNA 数

114

显著下调 miRNA 数

31

显著下调 mRNA 数

156

技术优势

揭示新调控网络

首次构建了 miR-147 缺失小鼠肺中的 ceRNA 网络，识别出大量差异表达的 lncRNA、miRNA 和 mRNA，为理解 miR-147 的调控机制提供了系统数据。

锁定关键枢纽基因

通过网络分析将 Kcnh6 鉴定为差异表达的枢纽基因候选物，为后续功能研究和临床靶点发现提供了方向。

关联肿瘤信号通路

通路富集表明，差异表达 lncRNA 和 miRNA 的靶 mRNA 参与肿瘤相关信号、子宫内膜癌、膀胱癌和 ErbB 信号通路，提示该网络可能影响肿瘤发生。

应用场景

• 癌症发病机制研究：用该网络数据筛选肿瘤相关调控靶点，辅助癌症发病机制研究。
• 非编码RNA调控：分析 lncRNA 和 miRNA 的相互作用，揭示非编码 RNA 的调控模式。
• 基因编辑模型：基于 miR-147 敲除小鼠模型数据，用于基因编辑模型的表型与网络分析。