域对抗去卷积网络

跨技术稳定去卷积

利用域对抗架构桥接单细胞与混合蛋白质组数据分布，无需单细胞参考数据即可实现细胞类型比例解析。

Fang, Wang · Fan, Yang · Longkai, Huang · Wei, Li · Song, Jiangning · Gasser, Robin B. · Aebersold, Ruedi H. · 汪国华 · Yao, Jianhua

Nature Machine Intelligence 2023

技术优势

无需单细胞参考

利用域对抗架构桥接单细胞与混合数据分布，将标签从单细胞数据迁移到混合数据，摆脱了对单细胞蛋白质组参考数据的依赖。

提升单细胞数据质量

利用自编码器从混合蛋白质组数据中提取信息，提升单细胞蛋白质组数据的质量，从而提高去卷积效果。

跨技术跨物种稳健

在多种物种来源和不同蛋白质组技术产生的数据上验证了去卷积性能，显示出良好的泛化能力。

应用场景

• 肿瘤微环境解析：解析肿瘤组织中不同细胞类型的比例，揭示微环境组成。
• 临床诊断分类：基于细胞类型比例进行疾病诊断和分型。
• 蛋白质组数据分析：从混合蛋白质组数据中估算细胞类型比例，补充现有分析流程。
• 单细胞数据整合：桥接单细胞与混合数据分布，实现标签迁移。
• 多组学去卷积：为多组学数据提供蛋白质组层面的去卷积工具。