红瘤茶染色体水平基因组

解析喀斯特适应机制

这一基因组揭示了红瘤茶对喀斯特高盐、干旱及钙胁迫环境特有的适应机制,为茶属物种的遗传改良和分子育种提供了关键资源。

Chao, Yan · Mingtai, An · 唐明 · 白新祥 · Xiao, Xu · 冉朝辉 · 李志

Plant Diversity 2025

参数信息

基因组大小
2.50 Gb
Scaffold N50
168.34 Mb
蛋白编码基因数
55302
染色体数
15

技术优势

基因组质量高

组装达到染色体水平,scaffold N50 高达 168.34 Mb,可支持高质量的基因注释和比较基因组分析。

锁定关键胁迫通路

选择性清除分析发现与植物激素传导和代谢相关的基因,并鉴定出多个参与钙稳态和离子转运的胁迫响应基因。

揭示喀斯特适应机制

发现两次全基因组复制事件后,与光合作用等喀斯特适应相关的基因家族显著扩张,MYB 转录因子可能在干旱和高盐胁迫中发挥关键作用。

应用场景