片段连接子预测网络

快速生成PROTAC类似物

一个直接根据蛋白复合物结构生成连接子的深度网络，几步就能得到有更好结合力的 PROTAC 分子，省去传统设计里的反复试错。

Lin, Wen Chieh

Journal of Chemical Information and Modeling 2023

技术优势

生成即得高亲和力

模型从已知三元复合物直接学习连接子模式，生成分子对接后 RMSD 更小、结合自由能更低，无需从头筛选大库。

剔除不可成药结构

生成过程集成基于蛋白-蛋白复合物的过滤器，自动排除不符合成药性规则的结构，保留具有强化学性质分子。

应用场景

• PROTAC药物设计：快速生成连接子，缩短 PROTAC 设计周期，提高候选分子结合力。
• 生物大分子药物：针对蛋白-蛋白相互作用界面设计降解剂，拓展大分子药物形式。
• 小分子靶向药：生成类药性小分子连接子，改善靶向降解药物的成药性质。
• 药物递送：通过双功能分子设计实现靶蛋白与 E3 连接酶的精准递送与降解。