深海鳗鱼基因组

揭示深海适应

该基因组组装为探索脊椎动物在高压、低温与食物匮乏环境下的适应机制提供了关键遗传资源。

Jie, Chen · 曾宏辉 · Wen-Qi, Lv · Ning, Sun · Wang, Cheng · Xu, Wenjie · Hu, Mingliang · Xiaoni, Gan · 贺丽生 · 何舜平 · Fang, Chengchi

Science China Life Sciences 2023

参数信息

基因组大小
1.47 Gb
假染色体数量
14
分化时间
111.9 Mya

技术优势

可解析深海适应

基因组组装质量高,包含14条假染色体,为定位与高压、低温、食物匮乏相关的基因提供了结构基础。

揭示细胞骨架适应

正选择基因TUBGCP3和扩张的MLC1基因家族可能增强细胞骨架稳定性,从而对抗高压。

维持膜流动性

ACOX1基因受到正选择,可能增强细胞膜流动性并维持转运活性,适应高压环境。

保护DNA完整性

ABCC12基因家族扩张可能增强DNA完整性,应对深海高压造成的损伤。

应用场景