叶䗛染色体级基因组

解密叶状拟态

首个叶䗛科染色体水平参考基因组揭示resilin基因在叶状拟态形成中的作用

Mao, Chuyang · Dong, Zhiwei · Li, Zihe · Zhou, Botong · 胡毅 · Li, Jun · Liu, Guichun · 周政 · He, Jinwu · Wu, Yuhan · Wan, Wenting · 赵若苹 · Nie, Wenhui · 王文 · Li, Xueyan

GigaScience 2026

具体参数

基因组组装大小
{'zh': '4.12', 'en': '4.12'} Gb
scaffold N50
{'zh': '256.9', 'en': '256.9'} Mb
BUSCO 完整性
{'zh': '98.6', 'en': '98.6'} %
锚定到假染色体的序列比例
{'zh': '98.3', 'en': '98.3'} %
假染色体数量
{'zh': '15', 'en': '15'}
预测蛋白编码基因数
{'zh': '19131', 'en': '19131'}
重复序列大小
{'zh': '2.29', 'en': '2.29'} Gb
resilin 基因拷贝数
{'zh': '24', 'en': '24'}

技术优势

组装完整性高

组装覆盖 98.3% 的序列并锚定到 15 条假染色体，达到 98.6% 的 BUSCO 完整度，为后续功能基因组研究提供可靠参考。

直接锚定到染色体

利用 Hi-C 技术将 contigs 挂载到 15 条假染色体（13 条常染色体、1 条 X 染色体、1 条疑似 B 染色体），便于进行染色体演化分析。

定位到关键基因

比较基因组和转录组分析发现 resilin 基因有 24 个拷贝，其中 10 个在腹部叶状扩展部位差异表达，提示其参与叶状拟态形成。

多组学数据可用

提供染色体级基因组组装、注释及不同发育阶段的转录组数据，支持对该物种及其近缘类群的比较研究。

应用场景